Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PADI4Q9UM07 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms