Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULX5

RNF112, RING finger protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF112Q9ULX5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF112Q9ULX5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF112Q9ULX5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF112Q9ULX5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF112Q9ULX5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF112Q9ULX5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF112Q9ULX5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF112Q9ULX5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF112Q9ULX5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF112Q9ULX5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF112Q9ULX5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF112Q9ULX5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF112Q9ULX5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms