Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRID1Q9ULK0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms