Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDH7Q9ULB5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms