Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MKLN1Q9UL63 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKLN1Q9UL63 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MKLN1Q9UL63 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MKLN1Q9UL63 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MKLN1Q9UL63 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MKLN1Q9UL63 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MKLN1Q9UL63 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MKLN1Q9UL63 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKLN1Q9UL63 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKLN1Q9UL63 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKLN1Q9UL63 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms