Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CHIC2Q9UKJ5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CHIC2Q9UKJ5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CHIC2Q9UKJ5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms