Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRLS1Q9UJA2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRLS1Q9UJA2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRLS1Q9UJA2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRLS1Q9UJA2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRLS1Q9UJA2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRLS1Q9UJA2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRLS1Q9UJA2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRLS1Q9UJA2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRLS1Q9UJA2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRLS1Q9UJA2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRLS1Q9UJA2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CRLS1Q9UJA2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CRLS1Q9UJA2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRLS1Q9UJA2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRLS1Q9UJA2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRLS1Q9UJA2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRLS1Q9UJA2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRLS1Q9UJA2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRLS1Q9UJA2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRLS1Q9UJA2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRLS1Q9UJA2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRLS1Q9UJA2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms