Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPN3Q9UHW5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms