Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPN4Q9UHM6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms