Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD4

CIDEB, Cell death activator CIDE-B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIDEBQ9UHD4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIDEBQ9UHD4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIDEBQ9UHD4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIDEBQ9UHD4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIDEBQ9UHD4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIDEBQ9UHD4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIDEBQ9UHD4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIDEBQ9UHD4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CIDEBQ9UHD4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CIDEBQ9UHD4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CIDEBQ9UHD4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CIDEBQ9UHD4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CIDEBQ9UHD4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIDEBQ9UHD4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms