Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLIP2Q9UDT6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms