Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms