Protein–RNA interactions for Protein: Q9P032

NDUFAF4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF4Q9P032 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFAF4Q9P032 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFAF4Q9P032 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFAF4Q9P032 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFAF4Q9P032 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFAF4Q9P032 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFAF4Q9P032 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFAF4Q9P032 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFAF4Q9P032 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDUFAF4Q9P032 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms