Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR8

ING3, Inhibitor of growth protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING3Q9NXR8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ING3Q9NXR8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms