Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms