Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF38Q9NXL2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGEF38Q9NXL2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms