Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWA0

MED9, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED9Q9NWA0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED9Q9NWA0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MED9Q9NWA0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms