Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL11Q9NVR0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL11Q9NVR0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL11Q9NVR0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms