Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZCCHC3Q9NUD5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms