Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FOXD4L1Q9NU39 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOXD4L1Q9NU39 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms