Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CISHQ9NSE2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CISHQ9NSE2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms