Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HELLSQ9NRZ9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms