Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS4Q9NRS4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms