Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP84

TNFRSF12A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 12A, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF12AQ9NP84 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF12AQ9NP84 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms