Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAC7

SUGCT, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUGCTQ9HAC7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUGCTQ9HAC7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUGCTQ9HAC7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUGCTQ9HAC7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUGCTQ9HAC7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUGCTQ9HAC7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUGCTQ9HAC7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUGCTQ9HAC7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SUGCTQ9HAC7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SUGCTQ9HAC7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SUGCTQ9HAC7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SUGCTQ9HAC7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUGCTQ9HAC7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SUGCTQ9HAC7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SUGCTQ9HAC7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUGCTQ9HAC7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUGCTQ9HAC7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUGCTQ9HAC7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUGCTQ9HAC7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUGCTQ9HAC7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms