Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SENP3Q9H4L4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SENP3Q9H4L4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms