Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms