Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
COMMD5Q9GZQ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COMMD5Q9GZQ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD5Q9GZQ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD5Q9GZQ3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD5Q9GZQ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COMMD5Q9GZQ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COMMD5Q9GZQ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COMMD5Q9GZQ3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COMMD5Q9GZQ3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COMMD5Q9GZQ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COMMD5Q9GZQ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COMMD5Q9GZQ3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms