Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AMBRA1Q9C0C7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms