Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4CQ9C0C4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms