Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A5Q9BY07 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A5Q9BY07 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A5Q9BY07 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A5Q9BY07 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A5Q9BY07 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A5Q9BY07 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A5Q9BY07 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A5Q9BY07 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A5Q9BY07 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A5Q9BY07 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A5Q9BY07 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A5Q9BY07 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A5Q9BY07 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A5Q9BY07 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC4A5Q9BY07 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms