Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf50Q9BV19 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms