Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKNK1Q9BUB5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MKNK1Q9BUB5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms