Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM79Q9BSE2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM79Q9BSE2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM79Q9BSE2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM79Q9BSE2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM79Q9BSE2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM79Q9BSE2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM79Q9BSE2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM79Q9BSE2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM79Q9BSE2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM79Q9BSE2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM79Q9BSE2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM79Q9BSE2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM79Q9BSE2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM79Q9BSE2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM79Q9BSE2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms