Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MGME1Q9BQP7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MGME1Q9BQP7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MGME1Q9BQP7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MGME1Q9BQP7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MGME1Q9BQP7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MGME1Q9BQP7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MGME1Q9BQP7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MGME1Q9BQP7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MGME1Q9BQP7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MGME1Q9BQP7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MGME1Q9BQP7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MGME1Q9BQP7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MGME1Q9BQP7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MGME1Q9BQP7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MGME1Q9BQP7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MGME1Q9BQP7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGME1Q9BQP7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGME1Q9BQP7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGME1Q9BQP7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGME1Q9BQP7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGME1Q9BQP7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGME1Q9BQP7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MGME1Q9BQP7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms