Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLX1AQ9BQ83 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLX1AQ9BQ83 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
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