Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPA33Q99795 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPA33Q99795 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms