Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PITX2Q99697 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PITX2Q99697 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PITX2Q99697 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PITX2Q99697 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PITX2Q99697 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PITX2Q99697 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PITX2Q99697 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PITX2Q99697 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PITX2Q99697 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PITX2Q99697 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PITX2Q99697 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PITX2Q99697 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PITX2Q99697 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PITX2Q99697 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PITX2Q99697 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PITX2Q99697 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PITX2Q99697 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PITX2Q99697 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms