Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CGREF1Q99674 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms