Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EYA3Q99504 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms