Protein–RNA interactions for Protein: Q96S55

WRNIP1, ATPase WRNIP1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WRNIP1Q96S55 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
WRNIP1Q96S55 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
WRNIP1Q96S55 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms