Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KC1Q96S38 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms