Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NSMCE3Q96MG7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms