Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms