Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS50Q96JG6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms