Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ABCC11Q96J66 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
ABCC11Q96J66 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ABCC11Q96J66 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ABCC11Q96J66 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms