Protein–RNA interactions for Protein: Q96HL8

SH3YL1, SH3 domain-containing YSC84-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3YL1Q96HL8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SH3YL1Q96HL8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3YL1Q96HL8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms