Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BCANQ96GW7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BCANQ96GW7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
BCANQ96GW7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
BCANQ96GW7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
BCANQ96GW7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
BCANQ96GW7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
BCANQ96GW7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms