Protein–RNA interactions for Protein: Q96D71

REPS1, RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1Q96D71 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REPS1Q96D71 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms