Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKD2Q969F2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NKD2Q969F2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms